然而，礦業權出讓收益制度在執行過程中，也遇到了一些新的情況和突出的問題：一是礦業權出讓收益改革加重了企業負擔。以某國有能源集團為例，某煤礦服務年限在70年以上，而礦業權出讓收益要求30年內繳清，意味著企業需在近80%資源未動情況下提前支付所有費用。如按現行政策執行，全集團未來需繳納礦業權出讓收益近千億元，礦業權出讓收益金額巨大，加重了企業負擔。二是缺乏統一指導細則助長了地方政府財政短期行為。煤炭礦業權市場基準價下放地方后，國家沒有制定統一的指導細則，各省（區）自由定價權過大，一些地方政府在實際征收時遠遠高于20%這一比例，部分省份甚至高達50%。首期繳納比例過高且長期收益短期繳納，增加企業在安全生產、綠色低碳發展和智能化煤礦建設等方面的投入壓力，制約了煤炭行業轉型升級和綠色低碳循環發展。三是不利于能源資源安全保障。原來只有國家出資探明礦產地，企業才需要繳納礦業權價款，35號文出臺后企業出資勘查的新增資源儲量也需繳納礦業權出讓收益，未能體現企業出資勘查風險投入收益和價值發現功能，同時企業勘查發現的資源儲量越多，繳納的出讓收益越多，影響了企業和社會資金投入勘查工作的積極性。目前的《礦業權出讓收益征收管理暫行辦法》嚴重影響了煤炭企業投資煤炭勘查、生產的積極性，不利于煤炭安全穩定供應和應急保障能力建設，改進完善礦業權出讓收益繳納方式迫在眉睫，筆者建議：

　　研究制定礦業權出讓收益率征收政策機制。開展煤炭礦業權出讓收益率征收試點，一次性計算所有資源量的礦業權出讓收益總值，首次繳納20%，在煤礦投產后，按照原煤產量每年征收礦業權出讓收益。同時，相關部門在制定礦業權出讓收益率基準價時，要綜合考慮資源的屬性和賦存等條件，綜合平衡調整礦業權出讓收益市場基準價。

　　盡快制定全國統一的礦業權出讓收益征收標準和減免規定。研究制定國家統一的征收指導細則，明確出讓收益市場基準價、基準率區間。明確對因資源枯竭、煤與瓦斯突出、水文地質條件極其復雜、深井開采和生態保護等原因退出的礦山，減免出讓收益。